BEEB@Lyon
Parcours Bioévaluation des Ecosystèmes et Expertise de la Biodiversité
Le M2 parcours BEEB « Bioévaluation des Ecosystèmes et Expertise de la Biodiversité » a accueilli sa première promotion d’étudiants dans sa nouvelle version à la rentrée 2016. Vous trouverez ci-dessous toutes les informations nécessaires pour découvrir la nouvelle offre de formation, son fonctionnement, les modalités d’inscription et les débouchés.
Responsable : Jean-Paul Léna
Laboratoire d’écologie des hydrosystèmes naturels et anthropisés (LEHNA)
UMR 5023
Bâtiment Forel/Darwin
43 boulevard du 11 Novembre 1918
69622 VILLEURBANNE cedex
contact: jean-paul.lena@univ-lyon1.fr
Formation
Objectifs de la formation
Le Master BEEB forme des professionnels de l’ingénierie écologique, spécialisée dans la protection, la gestion et la restauration des écosystèmes et des espaces naturels, périurbains ou urbains dans le cadre de l’application des directives et politiques environnementales.
Les diplômés interviennent dans des missions d’expertise, de conseil et de suivi de projets environnementaux, en lien avec les enjeux de conservation de la biodiversité et d’aménagement du territoire.
Compétences
Les diplômés sont formés à :
- Analyser le fonctionnement des écosystèmes ;
Réaliser des diagnostics écologiques et des suivis de biodiversité ; - Identifier les enjeux de conservation et contribuer à la délimitation de zones prioritaires pour la préservation des milieux naturels ;
- Évaluer les impacts environnementaux de projets d’aménagement, ainsi que l’efficacité d’actions de protection ou de restauration ;
- Participer aux analyses réglementaires des études d’impact ;
- Concevoir et mettre en œuvre des mesures écologiques, notamment dans le cadre de la séquence Éviter – Réduire – Compenser (ERC) ou de plans de gestion d’espaces naturels ;
- Coordonner des projets environnementaux impliquant différents acteurs socio-économiques.
Originalités et force de la formation M2 BEEB :
La formation repose sur :
- Une approche scientifique (contribution des équipes de recherche) et quantitative, associée à de solides compétences naturalistes ;
- De nombreux travaux pratiques et mises en situation sur le terrain, favorisant l’acquisition de compétences opérationnelles ;
- Le développement de compétences en gestion de projet, travail d’équipe et pluridisciplinarité.
En effet, La formation BEEB bénéficie de nombreux partenaires en gestion de l’environnement ou issus des collectivités locales. Ces partenaires jouent un rôle majeur dans l’offre de stage et dans le recrutement des étudiants ; - L’intégration des aspects réglementaires et des politiques environnementales tout au long de la formation.
Contenu pédagogique et organisation des cours
Le premier semestre du M1 est commun à l’ensemble des parcours. Seul le stage d’intégration est spécifiquement dédié au parcours BEEB.
Les enseignements spécifiques au Master BEEB débutent dès le deuxième semestre du M1 et sont complétés par des enseignements hors maquette sur d’une semaine en juin (expertise naturaliste).
Le M2 est annualisé, ce qui implique l’organisation d’un unique jury en septembre.
Le calendrier de formation est donc adapté aux spécificités du parcours : il permet de disposer de périodes suffisamment longues durant les phases phénologiques favorables, tant pour la réalisation du projet tutoré que pour le stage en entreprise. Cette organisation facilite le suivi complet des projets par les étudiants, depuis l’acquisition des données de terrain aux moments les plus pertinents, jusqu’à leur traitement et leur analyse.
(Voir calendrier prévisionnel de formation en haut de la page.)
Master 1 - Semestre 1
Stage d’intégration et enseignements hors maquette (spécifique au parcours BEEB)
L’objectif est de renforcer les compétences en expertise naturaliste sur différents milieux et groupes taxonomiques. Ces enseignements sont réalisés in situ avec des professionnels, principalement au cours du stage d’intégration (début septembre), ainsi que sur une semaine début juin en 1ère année. Ceux-ci viennent compléter les enseignements à visée opérationnelles réalisées dans les différentes UE du M1.
Sont ciblés, l’étude des groupes taxonomiques suivant :
– Phytosociologie et étude des macrophytes
– Odonatologie
– Lépidoptérologie
– Ornithologie
– Herpétologie
– Chiroptérologie
Pour plus d’informations sur les UE du premier semestre du M1, communes à tous les parcours du Master BEE, rendez-vous ici.
Master 1 - Semestre 2
Cette UE, majoritairement magistrale, vise à décrire l’organisation institutionnelle, les politiques ainsi que les outils de préservation de la biodiversité et des espaces naturels à différentes échelles spatiales.
Une partie TD permet d’illustrer l’application de certains outils de gestion et protection de la nature, dans des cas concrets (séquence ERC, plan de gestion ENS) ainsi que de se familiariser, au travers de mises en situation, à la logique d’acteurs et conflits d’usages.
Responsable : Fanny Colas
Cette UE traite du versant biologique de la conservation de la biodiversité, tant au niveau de la viabilité des populations que de la diversité des stratégies biologiques. L’approche de cette UE est donc plutôt espèce centrée, les approches de conservation et gestion des milieux étant plutôt abordées dans les trois autres UE de semestre 2. Dans le cadre de cette UE, il s’agira donc d’intégrer les acquis de différentes disciplines (démographie, génétique de populations, écologie comportementale, biologie évolutive) pour documenter le statut de conservation des populations et prédire leur altération consécutive de la fragmentation des habitats, de l’introduction d’espèces allochtones, ou de prélèvements abusifs. Les conditions de restauration d’une population sont analysées en particulier à la lumière de l’analyse des structures spatiales des paysages (notion de connectivité).
Les travaux dirigés et les travaux pratiques visent à donner aux étudiants une compétence opérationnelle quant aux outils utilisés en biologie de la conservation : approche intégrative en gestion des milieux et des écosystèmes (indicateurs de changements écologiques, indices de fonctionnement), approche démographique pour l’analyse de viabilité des populations (estimation des paramètres démographiques et modèles de projection) et approche génétique en conservation (hybridation, structuration et diversité génétique des populations, génétique du paysage).
Responsable : Jean-Paul Léna
Cette UE se focalise sur les milieux terrestres. Elle forme à l’identification et à la caractérisation des cortèges végétaux en lien avec les conditions environnementales locales. Cela permet ainsi d’interpréter les contraintes et particularités d’un milieu à l’aide de la description de la végétation. Elle aborde également les notions d’adaptations, accommodations et expression phénotypiques des espèces afin d’évaluer la qualité du milieu. Enfin, elle apporte des bases en systématique et taxonomie végétale, nécessaires à l’utilisation des plantes comme outils de bioindication. L’ensemble de ces connaissances est mis en application à travers des travaux pratiques sur le terrain (1 semaine).
Responsable : Antoine Vernay
Cette UE forme, selon une approche objet centrée (milieu aquatique), à la bioévaluation des milieux aquatiques. Très majoritairement pratique, elle s’organise autour d’un stage de terrain, consacré à la réalisation d’un diagnostic écologique en milieu aquatique, mobilisant des outils scientifiques (protocoles d’échantillonnage normés) et des compétences naturalistes pour qualifier le bon état écologique des masses d’eau.
Responsable : Émilien Luquet
Pour plus d’informations, rendez-vous ici.
Responsable : Johan PANSU
Master 2 - Enseignements disciplinaires
Statistiques pour analyses de séries temporelles – modèles mixtes
Responsable : Frank Sauvage
3 ECTS
Utilisation capteurs passifs (photo & acoustique) pour inventaires
Utilisation drone pour cartographie (photogrammetrie – NDVI)
Post-traitement SIG (analyse de connectivité du paysage)
Responsable : Jean-Paul Léna
6 ECTS
Droit de l’eau, droit de la biodiversité, réglementation étude d’impact (séquence ERC) pour demande de dérogation environnementale / plan d’urbanisme & aménagement
Responsable : Jean-Paul Léna
6 ECTS
Cette UE forme à la compréhension des enjeux liés à la restauration des écosystèmes. Elle aborde les fondements de l’écologie de la restauration, les techniques et approches méthodologiques adaptées aux différents écosystèmes, ainsi que la planification et la gestion de projets de restauration, en intégrant les enjeux socio-économiques et réglementaires. Les enseignements magistraux, sont complétés par des travaux dirigés et pratiques fondés sur des études de cas réels, incluant le suivi d’un projet de restauration en rivière, des visites de chantiers et des échanges avec les acteurs de la restauration écologique.
Responsable : Fanny Colas
SIG Niveau M2 (utilisations requêtes, Calculs LCP etc..)
Responsable: Cathy Quantin-Nataf (PU)
L’enseignement est dispensé par le Service Commun d’Enseignement des Langues de Lyon1 en vue de l’obtention du niveau B1.
3 ECTS
Dans ce parcours, le projet tuteuré individuel ou collectif propose à l’étudiant de gérer un projet sous contraintes de temps et de moyens. Ce projet peut être proposé par l’équipe pédagogique, par un organisme d’accueil ou par les étudiants eux-mêmes. Les projets collectifs présentent l’intérêt de développer l’aptitude au travail collaboratif. Le projet comprend une mise au propre du cahier des charges négocié avec l’organisme d’accueil et fait l’objet d’un compte rendu écrit (poster ou rapport) et d’une présentation orale. Un tuteur universitaire et des personnes « ressources » (enseignants-chercheurs ou autres professionnels) apportent, dans leur domaine de compétence, des éléments utiles au bon déroulement du projet (ex. aide intellectuelle ou matérielle, carnet d’adresse).
- Gestion de projet et recherche bibliographique
- Encadrement tuteuré
Pour plus d’informations, rendez-vous ici.
Equipe pédagogique : Jean-Paul Léna
Master 2 - Stage long
La deuxième partie de l’année de M2 est consacré à la réalisation d’un stage obligatoire de longue durée (30 ECTS). D’une durée de 4 à 6 mois, il permet une immersion dans le monde du travail dans le domaine de la gestion environnementale des espaces naturels et urbains. Au cours du premier semestre, chaque étudiant doit mener sa propre recherche de stage sur la base d’un cahier des charges établi avec les responsables du M2. Pour chaque étudiant, le sujet du stage et le choix de la structure d’accueil (un bureau d’études, une collectivité, un syndicat mixte, un conservatoire, un laboratoire, etc) devront être validés par le Comité de direction.
Le stage donne lieu à la rédaction d’un rapport de stage et à une soutenance orale.
Débouchés
Débouchés et insertion professionnelle
Les diplômés du Master BEE parcours BEEB accèdent principalement à des postes de cadre ou d’expert en ingénierie écologique. Les fonctions exercées incluent notamment :
Chargé de mission ou de projet
Animateur & coordinateur scientifique
Ingénieur d’études
Les diplômés peuvent exercer dans des structures publiques, privées ou associatives intervenant dans le domaine de l’écologie et de la gestion des milieux naturels :
Bureaux d’études en écologie (spécialisé ou non)
Entreprises de travaux de génie écologique
Écologues indépendants
Maîtres d’ouvrage aménageurs
Gestionnaires d’espaces naturels (Conservatoires d’espaces naturels, sites Natura 2000, parcs naturels régionaux…)
Services de l’État (DREAL, Directions départementales des territoires…)
Agences publiques (Agences de l’Eau, OFB, ONF, Parcs nationaux…)
Collectivités territoriales et EPCI (services environnement, aménagement, urbanisme, espaces verts, patrimoine naturel…)
Associations de protection de l’environnement
Organismes de recherche ou d’enseignement
Ces débouchés s’inscrivent dans les domaines de l’expertise écologique, de la gestion des espaces naturels, de l’évaluation environnementale et de la mise en œuvre de politiques publiques en faveur de la biodiversité.
Une enquête statistique est réalisée afin de suivre l’insertion professionnelle de nos anciens diplômés : cliquez ici
Pour la diffusion d’offres d’emploi, nous possédons une liste de diffusion des anciens étudiants du Master et de la Licence Pro ATIB..
Diverses offres d’emploi se trouvent sur le site suivant reconnu dans notre domaines : Résau-TEE ou sur le site web des entreprises du domaine d’activité.
Inscription
Modalités d'inscription et d'admission
L’entrée en parcours BEEB se fait dès le Master 1, via la plateforme MonMaster.
L’entrée en Master 2 est de droit pour les étudiants ayant validé leur 1ère année de Master Biodiversité, écologie, évolution au sein de l’Université Lyon 1. Ceux-ci doivent toutefois obligatoirement faire leur demande d’inscription via e-Candidat.
L’accès direct au niveau Master 2 est conditionné par l’obtention d’un diplôme (M1, école d’ingénieur…).
La capacité d’accueil du M2 étant limitée (capacité d’accueil de l’équipe pédagogique, bassin d’emploi), l’admission sera liée à la qualité du dossier ainsi qu’au projet professionnel défendu par le candidat. Celui-ci doit disposer de solides bases en sciences de l’environnement, écologie ou disciplines connexes, avec un intérêt marqué pour la gestion des espaces naturels et les politiques publiques environnementales.
L’étudiant devra obligatoirement solliciter un entretien avec le responsable du parcours avant l’inscription (ces entretiens peuvent se réaliser par téléphone ou via une visioconférence (telle que Webex)). En l’absence de prise de contact au moment de la commission d’admission, le dossier sera refusé ou au mieux placé en liste d’attente.
Dates de candidature M1 (MonMaster) : cliquez ici.
Dates de candidature M2 (e-Candidat) :
- Date limite* de candidatures > 15/06/2026 (* fermeture de l’application E-candidat)
- Examen des dossiers > 22/06/2026 au 07/07/2026
- Notification des candidats retenus (Liste principale, Liste d’attente, Refusé) > 07/07/2026
- Date limite de confirmation ou désistement > 13/07/2026
Constitution du dossier :
En cas de difficultés, contacter la scolarité l’UFR Biosciences :
scolarité.biosciences@univ-lyon1.fr
L’ensemble des documents à fournir pour l’inscription vous sera indiqué dans la procédure d’inscription. L’obtention du stage n’est pas obligatoire pour l’inscription, mais vivement conseillée. Les étudiants auront jusqu’en octobre pour trouver un laboratoire d’accueil pour ce stage. Nous attirons votre attention sur le fait qu’une lettre d’acceptation d’une équipe de recherche s’engageant à vous prendre en stage de recherche sera demandée.
Tout dossier incomplet (sauf pour les notes du semestre 2 de M1) sera refusé. Les notes du semestre 2 seront à faire parvenir au plus vite à l’UFR Biosciences.
N’hésitez pas à contacter le responsable du parcours pour vous aider dans votre recherche de stage.